Исследователи из Калифорнийского университета разработали единый геномный тест, который быстро обнаруживает любой патоген у пациента, включая вирусы, бактерии, грибки и даже паразитов. Фактически, тест позволяет быстро поставить диагноз по капле спинномозговой жидкости вместо того, чтобы врач делал предположения на основе симптомов и собственных знаний.
Методика называется геномным секвенированием нового поколения (mNGS), и специалисты разрабатывали её семь лет, в течение которых они проанализировали образцы 4828 пациентов. В ходе тестов учёные изучали образцы спинномозговой жидкости, циркулирующей вокруг головного и спинного мозга. Как показали результаты, mNGS точно определяет 86% неврологических инфекций, в том числе редких, которые быстро ухудшают состояние пациента.
Помимо того, что новая методика позволяет поставить диагноз всего за пару дней, она также предотвращает длительную госпитализацию и ошибочное лечение. И делается всё очень просто: из спинномозговой жидкости пациента извлекаются ДНК и РНК, которые затем анализируются через вычислительный конвейер. Миллионы последовательностей проходят через тестирование, и машина выявляет генетические сигнатуры патогенов всего за минуту. Этот метод также позволяет находить респираторные вирусы с пандемическим потенциалом, такие как SARS-CoV-2 и грипп.
Помимо тестирования с помощью спинномозговой жидкости, исследователи также приспособили тест mNGS для проверки пациента через дыхание. Система анализирует дыхательную жидкость за сутки и выявляет новые штаммы вирусов. Сейчас авторы методики работают над тем, чтобы mNGS можно было использовать с плазмой и другими жидкостями организма, и учитывая прорывной характер исследования, этот метод может быть рассмотрен комиссиями в течение нескольких месяцев, а не лет.