Невзирая на то, что пандемия прошла, повторные волны коронавирусной инфекции продолжают угрожать людям. Это побудило специалистов из ФНКЦ ФХМ им. Ю. М. Лопухина, МФТИ и Института биоорганической химии им. академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова создать новое соединение, которое претендует на звание лекарства от коронавируса.

Соединение влияет на геном вируса, подавляя его репликацию благодаря воздействию на синтез молекул РНК. У SARS-CoV-2 есть уязвимое место — особый узел на геномной РНК вируса под названием псевдоузел. Без этого псевдоузла не запустится переключение программы синтеза белков, то есть вирус не сможет размножаться в организме.

«Очевидно, что если этот псевдоузел удастся каким-то образом развязать, то размножение вируса остановится. Образно этот процесс можно представить как развязывание шнурков на ботинке. Мы растягиваем „бантик“, рибосома проходит его свободно, программа синтеза белка не переключается вовремя, и размножение вируса останавливается. Это уже пытались сделать до нас, но мы нашли слабое место в этом узелке, за которое весьма удобно тянуть. Это своеобразная петелька, за которую мы развязываем бантик», — пояснила автор исследования студентка пятого курса МФТИ Екатерина Книжник.

В рамках разработки учёные сравнили три типа полученных противовирусных кандидатов — аналогов нуклеиновых кислот, комплементарных стеблям псевдоузла. Три кандидата были представлены закрытыми нуклеиновыми кислотами (LNA), не полностью модифицированными аналогами ДНК с LNA-звеньями и фосфоротиоатами, содержащими G-зажимы (CPS).

Выяснилось, что лучше всех с развязыванием узла справилась LNA-модификация. Кроме того, аналоги олигонуклеотидов снизили репликацию SARS-CoV-2 в двух клеточных линиях человека. Более того, как пояснили учёные, лекарство на основе олигонуклеотидов не способно устареть, поскольку псевдоузел, в отличие от других компонентов, в вирусе не мутирует.